タンパク質はどのように折り畳まれるのか――私たちが観察したくても、その過程を見ることはできません。 そこで威力を発揮するのが、コンピューターによる分子シミュレーションです。これにより、タンパク質が折り畳まれる過程を観察することができます。分子シミュレーションを行うときに、基本となる情報を与えるのが力場です。力場の精度により、分子シミュレーションの精度も変わります。 また、力場は、X線やNMRによるタンパク質の構造決定にも影響を与えます。
私たちの研究室では、高精度で高速シミュレーションが可能な、SAAP力場の開発を行っています。
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